Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms