Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Msgn1Q9JK54 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Msgn1Q9JK54 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Msgn1Q9JK54 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Msgn1Q9JK54 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Msgn1Q9JK54 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Msgn1Q9JK54 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Msgn1Q9JK54 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Msgn1Q9JK54 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms