Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ4

Ube2j1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2j1Q9JJZ4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2j1Q9JJZ4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ube2j1Q9JJZ4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms