Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ddx20Q9JJY4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ddx20Q9JJY4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ddx20Q9JJY4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ddx20Q9JJY4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ddx20Q9JJY4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ddx20Q9JJY4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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