Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd3Q9JJY3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms