Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alyref2Q9JJW6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alyref2Q9JJW6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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