Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gfra4Q9JJT2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms