Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms