Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms