Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc86Q9JJ89 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc86Q9JJ89 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms