Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccl28Q9JIL2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl28Q9JIL2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms