Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI74

Klhl1, Kelch-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl1Q9JI74 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl1Q9JI74 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl1Q9JI74 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl1Q9JI74 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl1Q9JI74 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl1Q9JI74 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl1Q9JI74 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms