Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LratQ9JI60 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms