Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2ird1Q9JI57 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gtf2ird1Q9JI57 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gtf2ird1Q9JI57 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gtf2ird1Q9JI57 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2ird1Q9JI57 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2ird1Q9JI57 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2ird1Q9JI57 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2ird1Q9JI57 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2ird1Q9JI57 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2ird1Q9JI57 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2ird1Q9JI57 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2ird1Q9JI57 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2ird1Q9JI57 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2ird1Q9JI57 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2ird1Q9JI57 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2ird1Q9JI57 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2ird1Q9JI57 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2ird1Q9JI57 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2ird1Q9JI57 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2ird1Q9JI57 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2ird1Q9JI57 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2ird1Q9JI57 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2ird1Q9JI57 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2ird1Q9JI57 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2ird1Q9JI57 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2ird1Q9JI57 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2ird1Q9JI57 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2ird1Q9JI57 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2ird1Q9JI57 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2ird1Q9JI57 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms