Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI7

Exosc9, Exosome complex component RRP45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc9Q9JHI7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Exosc9Q9JHI7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms