Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET77

Jph3, Junctophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jph3Q9ET77 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Jph3Q9ET77 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Jph3Q9ET77 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms