Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim2Q9ESN6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim2Q9ESN6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim2Q9ESN6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim2Q9ESN6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim2Q9ESN6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim2Q9ESN6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim2Q9ESN6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim2Q9ESN6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim2Q9ESN6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim2Q9ESN6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim2Q9ESN6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim2Q9ESN6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim2Q9ESN6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim2Q9ESN6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim2Q9ESN6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim2Q9ESN6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim2Q9ESN6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim2Q9ESN6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim2Q9ESN6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim2Q9ESN6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim2Q9ESN6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim2Q9ESN6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim2Q9ESN6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms