Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Usp29Q9ES63 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Usp29Q9ES63 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Usp29Q9ES63 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp29Q9ES63 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms