Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snap29Q9ERB0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snap29Q9ERB0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms