Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tfip11Q9ERA6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfip11Q9ERA6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms