Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clstn2Q9ER65 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Clstn2Q9ER65 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms