Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn4aQ9ER60 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn4aQ9ER60 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn4aQ9ER60 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn4aQ9ER60 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn4aQ9ER60 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn4aQ9ER60 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn4aQ9ER60 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scn4aQ9ER60 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn4aQ9ER60 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn4aQ9ER60 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn4aQ9ER60 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn4aQ9ER60 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn4aQ9ER60 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn4aQ9ER60 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn4aQ9ER60 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn4aQ9ER60 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn4aQ9ER60 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn4aQ9ER60 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn4aQ9ER60 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn4aQ9ER60 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn4aQ9ER60 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn4aQ9ER60 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn4aQ9ER60 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn4aQ9ER60 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn4aQ9ER60 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn4aQ9ER60 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn4aQ9ER60 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn4aQ9ER60 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn4aQ9ER60 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn4aQ9ER60 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn4aQ9ER60 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn4aQ9ER60 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn4aQ9ER60 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn4aQ9ER60 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn4aQ9ER60 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn4aQ9ER60 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scn4aQ9ER60 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scn4aQ9ER60 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scn4aQ9ER60 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scn4aQ9ER60 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scn4aQ9ER60 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms