Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Barx1Q9ER42 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Barx1Q9ER42 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Barx1Q9ER42 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Barx1Q9ER42 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms