Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mrpl4Q9DCU6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mrpl4Q9DCU6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms