Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms