Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCC3

Ccdc107, Coiled-coil domain-containing protein 107, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc107Q9DCC3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc107Q9DCC3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms