Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rnf6Q9DBU5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rnf6Q9DBU5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rnf6Q9DBU5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf6Q9DBU5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf6Q9DBU5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rnf6Q9DBU5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms