Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Swt1Q9DBQ9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Swt1Q9DBQ9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Swt1Q9DBQ9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Swt1Q9DBQ9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Swt1Q9DBQ9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Swt1Q9DBQ9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Swt1Q9DBQ9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Swt1Q9DBQ9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Swt1Q9DBQ9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Swt1Q9DBQ9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Swt1Q9DBQ9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Swt1Q9DBQ9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Swt1Q9DBQ9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Swt1Q9DBQ9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Swt1Q9DBQ9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Swt1Q9DBQ9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Swt1Q9DBQ9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Swt1Q9DBQ9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Swt1Q9DBQ9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Swt1Q9DBQ9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Swt1Q9DBQ9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Swt1Q9DBQ9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Swt1Q9DBQ9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Swt1Q9DBQ9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Swt1Q9DBQ9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Swt1Q9DBQ9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Swt1Q9DBQ9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Swt1Q9DBQ9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Swt1Q9DBQ9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Swt1Q9DBQ9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Swt1Q9DBQ9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Swt1Q9DBQ9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Swt1Q9DBQ9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Swt1Q9DBQ9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms