Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SrpraQ9DBG7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms