Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE8

UPF0739 protein C1orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAE8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DAE8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DAE8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DAE8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DAE8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DAE8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DAE8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms