Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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