Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smco2Q9DA21 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smco2Q9DA21 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms