Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Y7

1700025F22Rik, RIKEN cDNA 1700025F22, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700025F22RikQ9D9Y7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700025F22RikQ9D9Y7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700025F22RikQ9D9Y7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700025F22RikQ9D9Y7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700025F22RikQ9D9Y7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700025F22RikQ9D9Y7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700025F22RikQ9D9Y7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700025F22RikQ9D9Y7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700025F22RikQ9D9Y7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
1700025F22RikQ9D9Y7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700025F22RikQ9D9Y7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700025F22RikQ9D9Y7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700025F22RikQ9D9Y7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700025F22RikQ9D9Y7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
1700025F22RikQ9D9Y7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700025F22RikQ9D9Y7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms