Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms