Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9D9H8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9D9H8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9D9H8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9D9H8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9D9H8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9D9H8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9D9H8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9D9H8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9D9H8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9D9H8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9D9H8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9D9H8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9D9H8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9D9H8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9D9H8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9D9H8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9D9H8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9D9H8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9D9H8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9D9H8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9D9H8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Q9D9H8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Q9D9H8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9D9H8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms