Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4bQ9D9F7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4bQ9D9F7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms