Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx5Q9D8U8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx5Q9D8U8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms