Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SlirpQ9D8T7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SlirpQ9D8T7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms