Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tvp23bQ9D8T4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms