Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S3

Arfgap3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap3Q9D8S3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfgap3Q9D8S3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms