Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q9D8Q6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms