Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8L0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8L0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8L0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D8L0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D8L0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D8L0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms