Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alkbh4Q9D8F1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms