Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl4Q9D8E6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl4Q9D8E6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms