Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C6

Med11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med11Q9D8C6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Med11Q9D8C6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Med11Q9D8C6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms