Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn22Q9D7U6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms