Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem54Q9D7S1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem54Q9D7S1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms