Protein–RNA interactions for Protein: Q9D753

Exosc8, Exosome complex component RRP43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc8Q9D753 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Exosc8Q9D753 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Exosc8Q9D753 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms