Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ccdc39Q9D5Y1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc39Q9D5Y1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc39Q9D5Y1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc39Q9D5Y1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc39Q9D5Y1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc39Q9D5Y1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc39Q9D5Y1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc39Q9D5Y1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc39Q9D5Y1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc39Q9D5Y1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc39Q9D5Y1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc39Q9D5Y1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc39Q9D5Y1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc39Q9D5Y1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc39Q9D5Y1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc39Q9D5Y1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc39Q9D5Y1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc39Q9D5Y1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc39Q9D5Y1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc39Q9D5Y1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc39Q9D5Y1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc39Q9D5Y1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc39Q9D5Y1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms