Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc81Q9D5W4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms